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Estudo da genômica aprimorada melhora a detecção de infecções diarréicas difíceis de encontrar

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Uma pesquisa universitária do Liverpool usou técnicas genéticas e genômicas avançadas para oferecer uma grande etapa para entender e diagnosticar intestinos infecciosos.

Estudos de tamanho grande analisaram mais de mil amostras de fezes para usar dois equipamentos de ponta de pessoas com doenças diarréicas.

Um sintoma comum de doenças intestinais infecciosas diarréia afeta aproximadamente 18 milhões de pessoas todos os anos no Reino Unido. No entanto, apesar de sua incidência, os testes tradicionais de laboratório geralmente deixam de detectar a causa, especialmente quando a infecção é causada por patógenos desconhecidos ou emergentes. Este novo estudo publicado utiliza seqüenciamento metazênico (baseado em DNA) e metatranscriptors (gene ou baseado em RNA). Ao contrário do método tradicional das marés, essas técnicas não dependem do crescente organismo em nenhum laboratório. Em vez disso, eles detectam e analisam os componentes genéticos diretamente das amostras de pacientes.

Escritor de co-líder.

O trabalho captura a primeira vez, um amplo instantâneo do gene Salmonella diretamente de qualquer amostra de shopping humano. Os dados transcritivos fornecem novas idéias sobre como as bactérias sobrevivem e se adaptam ao intestino humano. Como Salmonella continua sendo uma prioridade no Reino Unido como um patógeno diarréico, o conhecimento será inestimável para ajudar os cientistas a atingir esse patógeno perigoso.

As principais pesquisas do estudo destacam o poder do teste de RNA na detecção de infecções ocultas – identifique quais genes estão ativos durante a infecção, incluindo os parasitas não saudáveis ​​e o vírus do RNA. Significativamente, o RNA era estável mesmo nas amostras de shopping sem conservantes, sugere -se que seja mais forte do que o pensamento anterior. Significativamente, a proporção de RNA com DNA ajudou a distinguir a verdadeira infecção dos germes do intestino inocente. Os pesquisadores alcançaram o processo de infecção limpo e a imagem mais precisa combinando dados de DNA e RNA.

O vice-diretor do Centro Universitário de Pesquisa Genômica, Vice-Determinação, Alastar Derby diz: “Este estudo mostra que podemos revolucionar e entender como podemos detectar e entender o equipamento genital. Só podemos melhorar as reações de saúde pública, especialmente em alimentos”.

As pesquisas podem afetar significativamente como diagnosticado, gerenciado e estudado no Reino Unido e além disso – especialmente rápido, à luz da crescente necessidade de diagnósticos adequados que não dependem do método de cultura antiga.

A pesquisa também retrata o papel estratégico da pesquisa genômica (CGR) e a nova iniciativa Microbioma e Infeccsess Disease (MED) para o centro de Liverpool, que faz parte da região de inovação em ciências da vida na região da cidade de Liverpool.

O professor Alastire Derby também disse: “É mais do que o diagnóstico de infecção-trata-se de criar uma plataforma para inovação em saúde. Nosso trabalho anterior mostrou que os profissionais de saúde estão abertos a ela. Outros pesquisadores, laboratórios do NHS e organizações de saúde pública estão ajudando outros pesquisadores a acessar nossos dados a abrir”.

O Dr. Edward Cunningham-Oaks acrescentou: “Nossos resultados mostram que o RNA que já se pensa ser muito frágil para usar nos testes das fezes, pode nos dar uma visão forte sobre como a infecção funciona. Essas doenças abre mais efetivamente diagnosticando e tratando novas possibilidades”.

A pesquisa, incluindo o especialista em Salmonella, Dr. Blanca Perez-Sepulved e Professor J Hinton, foi liderada pela Unidade de Pesquisa em Saúde da Universidade de Liverpool (HPRU-GI) e pelo apoio à Associação de Proteção à Saúde e outros parceiros.

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