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Perfil imunológico de tamanho grande fornece uma visão da evolução do vírus da gripe

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Um novo estudo mostrou que os anticorpos desempenham um papel fundamental na formação de pessoas individuais a pessoa na imunidade, que as cepas de influenza (gripe) dominam em uma população.

Uma revisão do Eliff usa uma bunda baseada em seqüenciamento de alto thruput para medir a imunidade de anticorpos contra cepas de gripe H3N2 em crianças e adultos atualmente. Os editores o descrevem como uma pesquisa importante que progride nosso entendimento sobre a imunidade no nível da população e diz que o poder da prova é obrigatório. Este trabalho estará interessado em pesquisadores que trabalham em modelagem matemática de imunologistas, virologistas, desenvolvedores de vacinas e doenças infecciosas.

Os vírus da gripe acumulam mutações que ajudam a evitar anticorpos produzidos pela prevenção após suas infecções ou vacinas anteriores. Esse processo significa que as pessoas podem ser re -infectadas com gripe várias vezes em suas vidas e as vacinas precisam ser atualizadas regularmente para se manter eficaz. A reação de resistência da resistência humana à gripe é moldada por várias razões, incluindo as cepas que uma pessoa tinha antes.

“A diferença entre um grupo de infecções e vacinação de pessoas significa que a imunidade de uma variante específica da gripe é extremamente diversa”, estudantes de MD/PhD de Washington, Seattle, EUA e Departamento de Ciências Básicas do Departamento de Câncer Básico do Departamento de Câncer Básico. “É um desafio entender como essa raça afeta o sucesso evolutivo da nova tensão da gripe em toda a população, porque os métodos convencionais para determinar a quantidade de níveis de anticorpos são muito lentos e podem avaliar algumas amostras de punho de uma só vez”. A autora sênior de Kikawa, Jesse Bloom Lab, Programa Básico de Ciências e Biologia Computacional, cientista da equipe do Fred Hutch Cancer Center e gerente de laboratório, juntamente com Andrea Lois, também atuou como principal autor do estudo.

Para enfrentar esse desafio, Kikawa, Loes e colegas criam uma bolsa de neutralização de alto thru para medir a infecção por um painel de diferentes vírus da gripe que contém amostras de soro separadas. Hi-Thruput refere-se à capacidade da bolsa de processar muitos dados ao mesmo tempo.

A equipe produziu o vírus publicando 78 proteína distinta de hemaglutinina (HA) do vírus da gripe que não circula 2023 e os canudos recentes de vacina e marcou cada um com um ‘código de barras’ genético único. As proteínas HA podem mudar rapidamente para evitar uma parte do vírus reconhecidas pelos anticorpos e evitar a reação à resistência. A equipe misturou esses vírus com o soro e usa uma técnica chamada sequência Illumina para determinar o quão neutro cada vírus era.

Usando esse método, os pesquisadores mediram os níveis de neutralização – uma medida de quanto soro necessário para neutralizar o vírus – o oposto de 78 variantes de gripe usando 150 amostras de soro de crianças e adultos coletados nos Estados Unidos 2023. Total, eles criaram mais de 11.000 imagens de titros distintas, 2023-2024 da temporada.

Os resultados mostraram extensas variações nas reações de neutralização em indivíduos. Por exemplo, algumas das cepas mais testadas coletadas de crianças fortemente neutralmente neutralmente neutralizam outras, outras tiveram muitas reações fracas. Os adultos geralmente mostram imunidade mais consistente, mas ainda exibem variações suficientes individualmente. No geral, as maiores taxas de reações de neutralidade foram encontradas em um subconjunto de crianças, consistentes com a idéia de que as reações de anticorpos nas primeiras décadas de vida são as mais altas das cepas neutralizadas. Também pode ser que as crianças tenham o risco de gripe e, portanto, a maior probabilidade de aumentar o recente impulso imunológico. Essas missões destacam que a imunidade é extremamente personalizada na gripe.

Para avaliar como essa variação afeta a evolução do vírus, os pesquisadores comparam tits neutros com a taxa de crescimento de cada tensão viral durante a estação da gripe de 2023. Eles usaram um modelo estatístico chamado rigração logística multinomial para analisar a frequência de cada cepa no tempo da população humana e compara uma fração de amostras de soro intensificadas por baixa neutralização contra cada cepa.

Eles descobriram que as cepas de maior sucesso foram salvas da neutralização na fração maior de soros. Especificamente, as cepas eram mais propensas a aumentar na frequência quando uma alta porcentagem de pessoas estava em camadas abaixo de uma margem, o que indica imunidade fraca contra essa tensão. Ele sugere que as bundas neutras baseadas em sequenciamento de grande porte podem ajudar a nos informar sobre a evolução do vírus da gripe.

Esse relacionamento foi medido quando a neutralização foi medida usando um melhor separado, mas não quando o melhor foi apontado juntos. Em alguns sistemas de vigilância de vírus, as amostras de soro de Poole são usadas para estimar a imunidade da população. No entanto, essa pesquisa sugere que as medições puxadas podem deixar de capturar toda a gama de reações observadas nos indivíduos.

“Nossas consultas mostram que a população não é apenas a capacidade média de resistência, a resistência de nível distintiva, a causa raiz da qual a gripe é a mais bem -sucedida”.

Embora o estudo envolva um grande número de medições de TITAR, os autores observaram que as amostras foram coletadas de posição limitada e faixas etárias. A maioria das amostras infantis veio de um hospital em Seattle, enquanto amostras de adultos foram retiradas das coortes de vacinas da Filadélfia e da Austrália. Como resultado, o conjunto de dados não pode refletir completamente os padrões globais de resistência.

“No entanto, é um dos maiores conjuntos de dados para conectar a imunidade de anticorpos humanos com o sucesso de uma população”, professor do Centro de Ciências Básicas de Fred Hutch e professor do Programa de Biologia Computacional de Herbold e Professor Sênior e Professor Senior Writer e HMI Bloom. “Este método fornece uma estrutura para entender como a história de várias resistência pode afetar a evolução viral, e esses métodos podem complementar o sistema de vigilância existente e apoiar as decisões de composição da vacina, fornecendo informações mais detalhadas sobre a população”.

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