Os vírus gigantes desempenham um papel na sobrevivência de um único organismo marinho baseado em células, conhecido como proteista. Isso inclui algas, ameba e flagelas que formam a base das redes de alimentos do mar. E como esses manifestantes formam um órgão importante da disciplina alimentar, esses grandes vírus de DNA geralmente são responsáveis pelo risco de várias saúde pública, incluindo flores algas nocivas.
Um novo estudo dos cientistas da Escola Marinha, Atmosférica e da Ciência da Terra pode ajudar a revelar nossas vias navegáveis e vários tipos de vírus presentes no oceano. Esse conhecimento pode ajudar os líderes locais melhor a se preparar quando uma flor de algas prejudiciais pode afetar sua costa ou qualquer outro vírus está presente no Golfo, rio ou lago local.
Os pesquisadores identificaram publicamente o 230 Novo vírus gigante e apresenta sua eficácia em conjuntos de dados metazênicos marinhos disponíveis, usando métodos de computação de alto desempenho.
Jornal Nature NPJ Virus, Sua pesquisa inclui a descoberta de novos genomas de vírus gigantes antes. Entre esses genomas, 530 proteínas recém -funcionais foram apresentadas com nove proteínas envolvidas na iluminação. Isso indica que esses vírus podem lidar com o processo de seu hospedeiro e saloxilação durante a infecção.
“A diversidade e o papel dos vírus gigantes do mar e como eles se comunicam com algas e outros germes do mar, provavelmente podemos prever a flor de algas prejudiciais, que é o risco de saúde humana em todo o mundo e na Flórida”, disse Mohammed Moniruzzaman, Mohammad Moniruzzaman e um assistente do departamento. “Os vírus dos monstros geralmente são a principal causa de muitas mortes de fitoplâncton, que apóiam a rede alimentar e apóiam a fonte de alimento do romance no romance encontrado nos vírus gigantes, pois algumas dessas funções podem representar romances”.
Até recentemente, os vírus gigantes eram originalmente detectados por métodos científicos devido a restrições no pipeline bioinformático. Os pesquisadores criaram uma ferramenta inovadora chamada Deles (BPara equipamentos ionoformáticos EVírus eucariótico MaisDe Ikovari EMetragem AmbientalNOmes), projetado para detectar genomas de vírus gigantes em um amplo conjunto de dados de sequência de DNA público.
“Descobrimos que vírus gigantes possem de funções celulares, como metabolismo do carbono e fotossíntese – a tradição é encontrada apenas em organismos celulares, Benjamin Minch, um principal autor de pesquisa e estudante da biologia marinha e um estudante de doutorado no Departamento de Biologia Marinha”. BioGoquímica. “
Os escritores usaram o Instituto de Ciência e Computação de Dados (IDSC) para processar e combinar os maiores metazenomas da Universidade da Universidade de Miami – geralmente um gigabe para a biblioteca – ative centenas de bibliotecas comunitárias microbianas.
“Esta pesquisa nos permitiu criar uma estrutura para melhorar o equipamento existente para a detecção do romance o romance que pode nos ajudar com a capacidade de passar por poluição da água e patógenos”. Adicione min.
A equipe de pesquisa baixou os dados de sequência de DNA de nove maiores projetos globais de amostragem oceânica que se estendem de pole para polo. Usando Berren, eles recuperam o genoma do vírus gigante dos dados. Os genomas foram usados usando o banco de dados de funções gene universalmente disponíveis para identificar as funções codificadas por esses vírus. Atualmente, esses genomas foram comparados à detecção de romances com todos os representantes de vírus gigantes disponíveis.
O programa de saída usado para facilitar este estudo preenche uma lacuna no campo de pesquisa, fornecendo um equipamento facilmente utilizável e único para a detecção e classificação de vírus gigantes nos conjuntos de dados de sequência. Bern está disponível para uso de qualquer pessoa e pode ser baixado aqui:
Publicado em 21 de abril de 2025 na revista intitulada “Variações genômicas e funcionais do vírus da gigante global do Ocean Giant” Vírus da natureza NPJ. Os autores são Benjamin Minch e Miami Rostel School of Marine, Atmosferic e Mohammad Moniruzzaman, da Universidade da Ciência da Terra.
