Uma nova pesquisa internacional sugeriu que o antigo DNA viral que foi incorporado ao nosso genoma, que foi prolongado como um “lixo genital”, pode realmente desempenhar um forte papel no controle da expressão do gene. Pesquisadores no Japão, China, Canadá e Estados Unidos, com foco em uma família chamada Mer11, mostraram como esses elementos são lançados e fechados, especialmente como lançar e interromper o desenvolvimento humano inicial.
Os ingredientes transpostos (TES) são a sequência de DNA do genoma que se originou do vírus antigo. Mais de um milhão de anos, eles são copiados por todo o genoma e espalhados por processos de pasta. Hoje, o TES produz cerca de metade do genoma humano. Embora se pensassem que eles cumpriram uma função eficaz, estudos recentes mostraram que alguns deles agem como “interruptores genéticos”, controlando as atividades do tipo de célula mais próximo.
No entanto, como os TEs são extremamente repetitivos e muitas vezes quase idênticos em ordem, eles podem ser difíceis de estudar. Especificamente, pequenas famílias T como Mer11 foram mal classificadas nos bancos de dados genômicos existentes, limitando seu papel de entender seu papel.
Para superar isso, os pesquisadores criaram um novo método para classificar o TES. Em vez de usar ferramentas de vacina padrão, elas agrupam as seqüências Mer11 com base em suas relações evolutivas e quão bem armazenadas no genoma dos primatas. Essa nova abordagem foi autorizada a dividir Mer11a/B/C em quatro subfamílias distintas, a saber, através de Mer11_G1G4, do mais velho ao mais novo.
Esse novo gene de classificação revelou os padrões ocultos antes das possibilidades regulatórias. Os pesquisadores compararam a nova subfamília de MR11 a vários marcadores epigonáticos, que são as etiquetas químicas do DNA e proteínas relacionadas que afetam as atividades genéticas. Ele mostrou que essa nova classificação estava mais intimamente integrada à função regulatória real em comparação com a abordagem anterior.
Para examinar diretamente se as seqüências Mer11 podem controlar a expressão do gene, a equipe usou uma técnica chamada lentivipra (lantiviral amplamente paralelo repórter Ashe). Esse método insere milhares de seqüências de DNA nas células de uma só vez e permite que cada gene seja testado imediatamente, medindo quanto a atividade de cada gene é aprimorada. Os pesquisadores aplicaram esse método a cerca de 7000 seqüências de 11 MR 11 de pessoas e outros primatas e mediram seus efeitos nas células -tronco humanas e nas células neurais nos estágios iniciais.
Os resultados mostraram que Mer11_G4 (a subfamília mais jovem) mostrou uma forte capacidade de ativar o gene do gene. Ele também possuía um conjunto distinto de “motivos” regulatórios, que serviu como local de ancoragem para o fator de transcrição, que serve como um local de acoplamento para o fator de transcrição, controla as proteínas quando os genes estão ligados. Esses motivos podem afetar drasticamente como os genes reagem a sinais de desenvolvimento ou sinais ambientais.
Análises adicionais mostram que as seqüências Mer11_G4 em pessoas, chimpanzés e macaccles mudaram cada um de um pouco de maneira diferente ao longo do tempo. Algumas sequências em pessoas e chimpanzés adquiriram mutações que podem aumentar suas chances regulatórias nas células -tronco humanas y
“Lixo” fornece um modelo para entender como o DNA pode se transformar em elementos regulatórios com papéis biológicos importantes. Ao identificar a evolução dessas seqüências e examinar sua eficácia diretamente, os pesquisadores mostraram como cooperar nas atividades gênicas no antigo DNA viral primário.
“Nosso genoma foi sequenciado há muito tempo, mas a eficácia de muitas partes permanece desconhecida”, o autor de co-resposta. Nota Ino. Acredita -se que os elementos de transplante desempenhem um papel importante na evolução do genoma, e espera -se que seu significado seja mais claro à medida que a pesquisa avança.
