Uma equipe de pesquisa decodificou o genoma do histórico cultivo de batata tihásico e usou o recurso para desenvolver um método eficiente para analisar várias centenas de genomas adicionais de batata.
A batata é a comida principal para mais de 1,3 bilhão de pessoas. No entanto, apesar de sua importância para a proteção global de alimentos, os sucessos de criação foram modestos. O cultivo de batata mais popular nasceu há várias décadas. A razão para esse sucesso limitado é o complexo genoma da batata: cada célula contém apenas quatro cópias do genoma em vez de duas. Desafia a criação híbrida tradicional baseada em baseada em base. Uma equipe liderada pelo Instituto Max Planck, o principal professor do Instituto Max Planck para o Grupo de Pesquisa de Genoma e Genética Computacional do Genoma na LMU e o principal professor do Instituto Max Planck, alcançou um progresso importante. Como os pesquisadores relatam na revista NaturezaEles foram capazes de reconstruir o genoma do cultivo de dez batatas tihásicas históricas. Em seguida, eles usaram esse conhecimento para desenvolver um método que tornaria mais fácil e rápido reconstruir mais genomas de batata.
Em colaboração com pesquisadores da Universidade de Wagenzen, o Instituto Libniz de Planta de Plantas e Pesquisa de Plantas de Culturas (IPK) e a Universidade Shia Ziaotong na China, o partido escolheu as variedades históricas de Tihasic, algumas das quais já haviam sido cultivadas no século XVIII. “Desde que essa batata vem de uma época em que o programa de criação europeu começa, queríamos determinar o quão variado nesta batata entende as possibilidades genéticas de nossa batata”, disse Shanberger. A resposta foi: não muito. O pool genético de batatas é altamente limitado. Dez variedades de batata são cobertas cerca de 85 % da variável genética de todas as batatas européias modernas.
Impacto da obstrução após o lançamento da América do Sul
Os pesquisadores culparam suas explorações para interromper. A batata foi importada do século XVI da América do Sul. O número de pessoas diferentes era baixo e a maioria não conseguiu combater as condições européias. Esse pool genético reduzido foi então reduzido por outras doenças. O exemplo mais famoso é o último surto de praga da década de 1840 da década de 1840, fazendo com que as colheitas entrem em colapso, e é especialmente na Irlanda, mas também leva à fome catastrófica no resto da Europa.
Ao mesmo tempo, o estudo foi publicado – os pesquisadores surpreendidos – as diferenças entre cópias cromossômicas separadas podem ser enormes. “Como o pool genético é tão limitado, não há muitos cromossomos separados, mas quando os cromossomos são separados, eles nunca são desviados na quantidade de árvores domésticas antes”, explica o Shanberger. “As diferenças são cerca de vinte vezes maiores que os humanos”. Essas diferenças provavelmente foram levantadas antes da chegada das batatas na Europa. Os indígenas da América do Sul começaram a derramar batatas há cerca de 10.000 anos, e as diferenças foram provavelmente o resultado de atravessar as espécies selvagens.
Finalmente, os pesquisadores desenvolveram uma abordagem sofisticada que pode ser usada para analisar cerca de 2.000 batatas registradas na União Europeia. Em vez de produzir estritamente os dados necessários para a reconstrução do genoma, os dados facilmente produzidos são comparados aos genomas conhecidos do dia presente que estão presentes em qualquer cultivo. Os pesquisadores mostraram que suas perspectivas funcionam com o Ruset Barbank Cultivation, que existe por 5 anos e ainda é uma variedade padrão para batatas fritas. “O conhecimento das seqüências do genoma, desde a criação da árvore até o mais recente método de engenharia do genoma, forma a base de muitos métodos na reprodução de plantas”, diz Shanberger. “No futuro, não precisamos mais trabalhar sem essas informações”.
